La paroisse St-Godard est certainement antérieure au XII^e siècle. L’hypothèse selon laquelle elle aurait pu être la première cathédrale de Rouen est de plus en plus difficile à soutenir bien qu’elle relevait de l’église métropolitaine. Une dédicace initiale à Notre-Dame (ou même Ste-Marie-du-Faubourg dite Ste-Marie-hors-les-Murs) est douteuse. Les traces d’un patronage à saint Romain sont plus nombreuses. Par exemple, une Vie de saint Romain écrite vers la fin du XI^e siècle laisse entendre qu’elle portait le nom de l’évêque Romanus qui y fut inhumé en 639. Le corps de l’évêque y resta jusqu’à son transfert définitif dans la cathédrale peu avant 1090 par l’archevêque Guillaume Bonne Ame.

Les insignes reliques parties, l’église reçut une nouvelle dénomination. Les Rouennais, comme les moines de l’abbaye St-Médard de Soissons s’étaient certainement persuadés à cette époque que les deux prélats rouennais saint Godard et saint Romain avaient été enterrés dans la même église. Mais, la seule sépulture épiscopale dans cette église n’a jamais été que celle du second. Jusqu’au XIX^e siècle on y montrait un sarcophage de porphyre rouge, peut être d’origine antique.
En 1248, un incendie détruisit l’ancien édifice. Une nouvelle église fut reconstruite. Le sanctuaire primitif fut agrandi à bien des reprises et à diverses époques.
St-Godard, située à proximité du château de Bouvreuil, fut naturellement la paroisse du nouveau siège du pouvoir royal qui succéda à celui du duc de Normandie. Philippe Auguste, devenu maître de Rouen en 1204, construisit dès l’année suivante une forteresse et un donjon sur la petite colline surplombant légèrement l’église.
L’architecture générale de l’église, que l’on peut admirer actuellement, date essentiellement du XVI^e siècle, mais la tour carrée ne fut terminée qu’en 1613. Le clocher est toujours inachevé puisque sa flèche ne fut jamais construite.
Comme toutes les églises de Rouen, elle fut mise à sac par les Huguenots en 1562.
Au XVII^e siècle, François Farin, le célèbre historien de Rouen, fut “prêtre, clerc matriculier” de la paroisse. Il était alors chargé de tenir le matricule, registre sur lequel étaient inscrits les noms des clercs et des pauvres. Il remplissait parfois les fonctions de maître d’école. L’abbé Farin était originaire de la paroisse de St-Denis de Rouen.
L’essentiel du monument est des XV^e et XVI^e siècles.
Les trois nefs d’égale hauteur de St-Godard sont voûtées de bois. Ces voûtes datent de 1617-1618 et ont pu être réalisées avec des « douvains à pipe », comme pour la Salle des Procureurs du Palais de Justice. La possibilité de disposer de belles pièces de chêne de taille standard, sans défaut, en grande quantité montre certainement un beau désir d’économie !
De belles poutres traversent l’ensemble des charpentes. Une abside à trois pans termine la nef centrale. Le portail principal était autrefois précédé d’un avant-porche, aujourd’hui détruit. Les murs latéraux sont percés de deux portes. La porte sud ouvrait sur le cimetière qui s’étendait vers l’église St-Laurent. Depuis la disparition du cimetière, elle est condamnée.
La tour carrée date de la Renaissance. Ses portes gothiques portent les armes des Brézé.
Une crypte subsiste sous la chapelle saint Romain, dans le haut du bas-côté nord. Elle a été entièrement refaite au XVI^e siècle. Jusqu’au début du XX^e siècle, une messe y était dite chaque année, à la St-Romain. Elle recèle quelques vestiges des armoiries de la famille de Guiry qui prétendait descendre d’un frère de saint Romain. On y célébrait une messe annuelle à saint Romain.